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ドードーの作り方

編集者注、2009年9月22日 ベス・シャピロは、ジョン・Dとキャサリン・T・マッカーサー財団によって2009年のマッカーサー・フェローに選ばれた24人のうちの一人です。 彼女は500, 000ドルの「天才交付金」を受け取ります。

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ドードーDNAを分離しようとしている場合は、次の手順に従ってください。まず、化石化していないドードーの骨を見つけます。 これは簡単なはずです。 世界で知られている数少ないものの中に、オックスフォード大学自然史博物館の2階の箱に保管されている頭蓋骨と左足があります。 彼らは、最後のドードーが亡くなった頃の1683年以来、大学が所有しています。 大きな博物館ではありませんが、迷子になった場合は、1860年にチャールズダーウィンの進化論をめぐる伝説的な議論が行われた物置の入り口の横にある小さな飾り板を探してください。

生物学者のベス・シャピロが2000年に発見した困難な部分は、コレクション管理者のマルゴシア・ノヴァク・ケンプを説得して、再生不可能な究極のリソースを掘り下げることです。 確かに、多くを破壊する必要はありません(小指の爪の大きさの断片で十分です)が、2度目のチャンスはないと言っても安全です。 プレッシャーがあなたに届かないようにしてください。 「これは非常に有名な標本であり、非常に限られた資源であり、短いアメリカ人がやって来て、それから塊を取りたいと思っています」とシャピロは言います。 「[Nowak-Kemp]は私ほど怖くはなかった。」

次のステップは、ポリメラーゼ連鎖反応です。 父子鑑定からクローニングまであらゆることに使用されるPCRには、設備の整ったラボが必要です。 中に入る前に、コンピューターチップ工場で見られるような清潔なスーツを着て、サンプルが現代のDNAで汚染されないようにします。

準備はいい? OK:ドードーの骨を細かく砕く。 それを水ベースの溶液に溶かします。 マグネシウムとDNAポリメラーゼ、つまり遺伝子が自分自身のコピーを作るのを助ける酵素を混ぜてください。 混合物を華氏約150度に加熱して、DNA鎖を2本の鎖に分解します。 それを冷やして、ポリメラーゼ酵素にドードーのDNAをラッチさせ、そのコピーを構築させます。 少なくとも30回繰り返します。 朝までには、ドードー遺伝子または遺伝子断片のコピーが約100万個入った試験管が必要です。

31歳のシャピロにとって、この一見単純に聞こえる手順は成功の秘recipeです。 1999年にロードス学者としてオックスフォードに到着したとき、彼女は古代DNAの真新しい分野の先駆者であるアラン・クーパーに弟子入りしました。 それから6年で、シャピロは、古くからのDNA研究者の、小さくて知名度が高く、圧倒的に若いコミュニティのトップに躍り出ました。 彼女は最近、ペンシルベニア州で就職し、今秋から教え始めます。

古代のDNA研究では、死んだ植物や動物の遺伝子を分析します。科学者は、5年前には想像もできなかった精度で種の進化と絶滅を追跡できます。 たとえば、ドードーDNAを他の5種の遺伝子と比較することにより、シャピロの研究では、飛べない鳥はハトの遠い親wasであることが明らかになりました。 科学の 2004年の論文では、バイソンの衰退は、約37, 000年前の疑いよりもはるかに早く始まったため、主に北米の人間ハンターによるものではないと主張しました。 昨年、彼女がマンモスのゲノムについて共同研究した研究により、その最も近い生きている親類(驚くべきことにゾウ)の手がかりが得られました。

2年前、オックスフォードのヘンリーウェルカムエンシェントバイオモレキュラーセンターの責任者としてクーパーを交代させた後、シャピロは研究室に自分のスタンプを貼り始めました。 ごく最近、彼女はエイズウイルスの突然変異の追跡を始めました。 「彼女は多くの境界を越えています」と、ロンドン大学ロイヤル・ホロウェイの古代DNA研究者イアン・バーンズは言います。 「彼女は多くの異なる研究を管理する能力の点で、この分野で最高の人材の一人と考えられています。」

境界を越えることはお気に入りのモードです。 シャピロはまだ高校生の頃、ジョージア州ローマのテレビ局で放送ジャーナリストを目指していました。 大学では、彼女は中国語、地質学、スペイン語、英語の文学に追われ、その後エコロジー専攻に落ち着きました。 彼女はわずか3年で進化生物学の博士号をオックスフォードから取得しましたが、それでも大学のワインクラブを率い、地元のラジオコールインサイエンスショーを開催する時間を見つけました。

シャピロは、古くもさもなければDNAサンプルを求めて世界中を旅してきました。 ほとんどはドードーの骨よりもずっと見つけにくい。 カナダのユーコン準州で、彼女はテストするためにサンプルを集めている間に800歳のカリブーの糞に落ちました。 ケニアでは、シマウマの糞をつかむためにライオンをかわしました。 彼女はシベリアから羊毛のマンモスの骨を、アラスカからバイソンの遺骨を集めました。 昨年の夏、彼女はインド洋のモーリシャス島に飛び、化石化されていないドードーの骨を探して、オックスフォードの標本と比較しました。

彼女の同僚の多くと同様に、シャピロはクローニングに関する多くの質問を寄せています。 絶滅した種を再作成するというアイデアは、とても魅力的です。 しかし、科学者がまだ克服しなければならない大きな技術的課題があります:古代のDNAは多くの小さな断片になりがちで、生きた動物がなければ、どの遺伝子がドードーの発達のどの段階で作用するかを再構築する方法はありません。 つまり、ドードーママ、ドードーベイビーはいません。

しかしもっと重要なのは、生息地のない世界に種を戻すことが理にかなっているかどうかということです。 「確かに、絶滅種のクローン化について話すのはセクシーで知名度が高い」と彼女は言う。「しかし、もっと多くの重要な貢献ができる。人々は怠け者であり、クローン化が絶滅問題を解決する方法だと思う」 その代わりに、彼女は最初にいくつかの種が絶滅した理由を見つけようとし続けます。 彼女は、自分の研究が現代の種がドードーの道を行くのを防ぐのを助けることを望みます。

アンドリュー・カリーは、スミソニアンの6月号でルーマニアの塗られた修道院について書いています。 彼はベルリンに住んでいます。

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