ナショナルモールの向かい側にオフィスがあるにもかかわらず、パナマのボカスデルトロという小さな町でレティシアプレザンスに出会いました。 2009年9月で、ボカスのスミソニアン熱帯研究所のフィールドステーションにいました。サンゴ礁の生物学者ナンシーノウルトンと一緒に、サンゴ礁の大量産卵イベントを研究していました。 国立自然史博物館の海洋生態学者であるプレザンスは、ノウルトンのスキューバダイビングチームに所属していました。
STRIでの滞在中、Plaisanceは、自分自身の研究のために、沖合で自律的なリーフモニタリング構造、またはARMSと呼ばれるデバイスを沖に展開していました。 過去数年間で、インド、太平洋、カリブ海の指定された場所で、深さ26〜39フィートの死んだサンゴの頭や腕から、サイズが5ミリメートルから5センチメートルの甲殻類を収集しました。 最近、DNAバーコードを使用して、彼女は、予想よりはるかに多くの525種の甲殻類が、20.6平方フィートの自然および人工の構造物に住んでいると判断しました。 彼女のグローブトロット調査の結果である「サンゴ礁の多様性：不足しているものは何ですか？」というタイトルの研究が、ジャーナルPLoS ONEで利用可能になりました。 先日、私は彼女に追いつき、研究について話し合った。
どのサイトを含め、それらのサイトはどのように選択されましたか？
サンゴ礁に見られる多様性の範囲に及ぶサイトを選択しました。 通常、北部（オーストラリアのリザード島）には、南部（オーストラリアのヘロン島）や西部（グレートバリアリーフサイト）よりも、東部（フレンチフリゲートショールズ、ハワイ–ライン諸島）よりも多くの種が存在します。モーレア島、フレンチポリネシア）。 さらに、東インド洋（オーストラリア、ニンガルーリーフ）とカリブ海（ボカスデルトロ、パナマ）の2つの海洋盆地を追加しました。これらは非常に異なる進化史と生物地理学を持っています。 カリブ海のサンゴ礁は非常に劣化しており、インド太平洋地域とどのように比較されるかを見るのは興味深いものでした。
ARMSとは何か説明できますか？
ARMSは、ハワイのNOAAによって開発されました。 基本的に、それはすべての異なる種が落ち着く小さな家です。多くの流れのある開いた層を好む種や小さな洞窟が好きな種のために、完全に開いたまたは閉じた層で約20センチメートルです。 そこには、これらのさまざまな生息地がすべてあります。 それは、死んだサンゴの複雑さを大まかに模倣することになっている素晴らしいサンプリング装置です。 砂、草床、あらゆる種類の生息地で使用できます。 非常に簡単に処理でき、サイトごとに結果を比較できます。
どのくらいの頻度でサイトにアクセスしましたか？ そして、それぞれの収集についてどのように行ったのですか？
フィールドトリップの開催方法と時期に応じて、サイトを1回または2回訪問しました。 通常、午前中にダイビングします。 生きているサンゴの頭を見つけようとしました。 時々私たちは成功し、時には成功しませんでした。 その後、それらをラボに戻します。 私は主に一人で働いていましたが、時々ボランティアを手伝ってもらいました。 私は研究室で開始し、サンゴの頭を開き、それらを分解します。 サンゴの頭全体を調べるのに約1日かかりました。サンゴの頭の中にはたくさんのものが住んでいたからです。 目に見える甲殻類をすべて手に取り、流水で保管しました。 私は甲殻類を撮影し、写真を撮り、データを記録してから、分子研究のために少しの組織を取り、後の形態学研究のために体の残りを保存します。 私は形態学的研究をしませんでしたが、私たちはそうする人々と協力しているので、彼らのために残りの甲殻類を救います。 それから、DNAの配列決定に取り組む組織のみをワシントンに戻します。
なぜ甲殻類に注目することにしたのですか？
彼らはおそらくサンゴの頭に住んでいる最も多数のグループです。 それは約半分の甲殻類で、残りは軟体動物などです。 甲殻類は実に多様で豊富でした。 しかし、シーケンスも非常に簡単です。 軟体動物はシーケンスするのが面倒です。 これらの技術的な問題を避けるために、甲殻類を選びました。
DNAバーコードはどのように使用しましたか？
人々は現在、約10年間DNAバーコードを使用しています。 これは短いシーケンスフラグメントであり、すべてに対して同じフラグメントをシーケンスします。 ユニバーサルプライマーがあります。 もちろん、それほど簡単ではありません。 あなたにはいつも問題があります。 しかし、それは現在、他のすべての分子技術よりも簡単です。 各甲殻類の短い断片をシーケンスし、すべての異なる種のすべての断片を比較しました。 基本的に、5パーセント異なる場合、2つの異なる種です。 差異が5パーセント未満であれば、同じ種です。 ですから、私たちが持っている種の数を決定するのは本当に簡単でした。
合計で、525の異なる種が見つかりました。 あなたは何人を見つけると思っていましたか？
はい。 それほど期待していませんでした。 サンゴ礁の多様性の推定と比較して、多くのことがわかりました。 グレートバリアリーフでは、約200の十脚がありましたが、グレートバリアリーフには900があると想定されていました。 そのため、これまでに発表された推定値と比べてはるかに優れています。
すべてをシーケンスした後、自分のシーケンスを公開済みで利用可能なシーケンスと比較しました。 甲殻類の数種のみが以前に配列決定されており、それらの多くはおそらくまだ説明されていません。
次は何をしますか？
この研究のハイライトは、実際にサンゴ礁に飛び込み、サンゴ礁の美しさを目撃できることでした。 しかし、衝撃的な部分は、すべてが非常に速く破壊される方法を確認することでした。 2010年にパナマに戻ったとき、サンゴ礁は完全に漂白されていました。 気温は本当に高かった。 実際にARMSを展開した場所は、1年後のデッドゾーンでした。 もう生きているものは何もありませんでした。
サンゴ礁は、一般の人々や政府が知っているよりもはるかに重要だと思います。 現在、ローカルおよびグローバルに非常に多くの脅威があります。 破壊を見ることは耐えられない。 それが今、私が実際に保全に移行している理由です。
サンゴ礁の弾力性に興味があります。 リーフは位相シフトを受ける可能性があります。 基本的には、健全なサンゴがたくさんあり、数週間後にはサンゴ礁が生い茂った藻類ができます。 これらの位相シフトを逆転させる解決策を見つけようとしています。
